蛋白質組學

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蛋白質組學,糖基化蛋白質組學,多組學聯合分析
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北京蛋白質組學——修飾類產品相關問題→蛋白產品相關問題(八)

2022-08-04 10:25:10

蛋白質組學(英語:proteomics,又譯作蛋白質體學),是以蛋白質組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規律的科學。這個概念早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名詞。

上次分享了蛋白產品相關問題(七),本周二將分享蛋白產品相關問題(八)~

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1. 修飾組學都是分三個餾份嗎?比如乙?;头核鼗??

答案:是的

2. 如何判斷某個氨基酸發生了磷酸化?

答案:判斷修飾位點的工作都是由軟件搜庫時一次性完成的,搜結果中會給出修飾位點。

原理一般如下,質譜打到肽段,判斷某個地方是否發生磷酸化修飾,就是看某個肽段是否多了80Da的分子量,一般發生磷酸化是STY三個點,如果一個肽段例如VAMEKKTK,整個肽段就是多了80Da,不同碎片離子的分子量變化也能與這個位點相對應,所以就會判定磷酸化修飾就發生在了T這個位點上,因此判定這個位點發生了磷酸化修飾。

3. 磷酸化修飾的介紹、發生的位點、研究哪些方向會用到磷酸化?修飾蛋白組學分析中磷酸化修飾蛋白的富集方法有哪些,我公司用的是什么富集方法?

答案:磷酸化是一種常見的可逆的翻譯后修飾,在細胞信號傳導等眾多的生物過程中發揮調節作用,修飾常常發生在S、T、Y位點上;

研究信號轉導、細胞周期、生長發育以及癌癥機理等方向會用到;

富集方法:TiO2富集,固相金屬親和色譜IMAC富集, pY-1000基序抗體富集

我們公司采用具有順磁特性的多孔瓊脂糖 TiO2 磁珠作為工具,對模型樣品和復雜樣品中的磷酸肽進行富集。

4. 修飾蛋白組學分析中泛素化修飾:修飾的介紹、發生的位點、用到這種修飾的研究哪些方向及修飾肽段富集方法是什么?

答案:泛素化是指泛素(一類低分子量的蛋白質)分子在一系列特殊的酶作用下,將細胞內的蛋白質分類,從中選出靶蛋白分子,并對靶蛋白進行特異性修飾的過程。發生位點:K。

泛素化參與了細胞周期、增殖、凋亡、分化、轉移、基因表達、轉錄調節、信號傳遞、損傷修復、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調控,與腫瘤、心血管等疾病的發病密切相關。

二甘氨酰賴氨酸抗體富集:能夠特異性識別Gly-Gly- ε-Lys結構域的抗體,用于富集泛素化信號肽,廣泛用于泛素化修飾組學分析。

5. 修飾蛋白組學分析中乙?;揎棧盒揎椀慕榻B、發生的位點、用到這種修飾的研究哪些方向及修飾肽段富集方法是什么?

答案:蛋白質?;且环N特殊的蛋白翻譯后修飾,其修飾基團的供體由體內代謝途徑的中間產物,如乙?;揎椀囊阴;且阴]o酶A 提供。



北京蛋白質組學



修飾發生位點:K。

樣品經Trypsin酶切,本公司采用商品化試劑盒乙?;禺愋钥贵w進行乙?;亩蔚母患?。

6. 修飾蛋白組學分析中甲基化修飾:修飾的介紹、發生的位點、甲基化修飾的影響及修飾肽段富集方法是?

答案:蛋白質甲基化修飾(Methylation)是表觀遺傳學的重要研究內容之一。甲基化多發生在轉錄因子和核蛋白質上,也有少量胞質蛋白會發生。

修飾發生位點:K/R。精氨酸甲基化參與轉錄調控,介導DNA損傷修復。賴氨酸甲基化可調控組蛋白功能,參與基因轉錄的表觀調控。

利用CST公司針對不同甲基化位點和修飾形式的基序抗體對甲基化肽段富集后,再用LC-MS/MS分析,實現大規模甲基化蛋白質定

7. 修飾蛋白組學分析中糖基化修飾:修飾的介紹、發生的位點及修飾肽段富集方法是?

答案:糖基化修飾主要發生在內質網和高爾基體。主要過程是將糖基在糖基轉移酶作用下將糖鏈轉移至蛋白質,和蛋白質上的氨基酸殘基形成糖苷鍵。

修飾位點:O-糖基化修飾位點:S、T、K;N-糖基化修飾位點:N。

富集方法:利用HILIC富集。



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