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「青蓮鉅惠」雙11豪情巨獻,樣本需求量“‘毫’無下限”

2022-11-15 00:00:00

      基因組在一個特定的有機體中所有細胞中都是相似的,而蛋白質組在不同的細胞中是不同的。此外,蛋白質也沒有像DNA聚合酶鏈式反應(PCR)那樣的自我復制擴增機制。因此,需要足夠的樣本量來達到大量的蛋白質鑒定。樣品制備流程的每一步都會造成蛋白質含量的一定損失,缺乏足夠的生物樣品量常常是臨床研究遇到的一個問題,標準(宏觀)蛋白質組學方法可以容忍樣品損失,因為通常處理的蛋白質為微克到毫克。然而,標準程序可能不適用于有限尺寸的樣品,即當有數百到數千個細胞可用時,來自低豐度蛋白質的信號容易降低甚至缺失,導致被識別的蛋白質群數量減少。一種疾病的潛在生物標記物可能以相對較低的豐度存在。此外,生物標記物在分析時很容易被主要化合物掩蓋。通過開發微量蛋白組學方法,可以處理微克甚至納克的蛋白質,同時檢索有價值的蛋白質組覆蓋率,從而解決與有限尺寸樣本相關的問題。疾病(如癌癥)的早期過程通常在有限的范圍內發生,因此可供分析的樣本量很少。此外,當疾病進展時,通過標準蛋白質組學對細胞或組織體積的分析可能無法告知一個樣本內的分子異質性。微量蛋白組學方法有效地解決了這些問題。


近期使用微量蛋白組學方法研究的文獻總結(部分文獻展示)



圖1 超微量蛋白組送樣標準


青蓮百奧總結前人經驗,并且不斷進行方法開發與優化,豪情推出“‘毫’無下限”超低微量蛋白組學,MMB試劑盒(Microscale Magic Beads)+青蓮百奧蛋白質組學機器人(QLBIO-AP-96)帶您走出樣本少的窘境!


由不得你不信?。?!青蓮自測數據如下

分別用了20μL尿液、50ng的293T蛋白質、500個293T細胞、FFPE樣本、100ug 腦組織樣本利用青蓮百奧 MMB試劑盒(Microscale Magic Beads)配合青蓮百奧QLBIO-AP-96蛋白質組學自動化機器人進行了微量蛋白質組學測試。

 

圖二微量樣本鑒定數量柱狀圖



你以為這樣就結束了嗎?

“毫無下限”的在后面,外泌體蛋白質組學一直是近幾年的熱點及難點,尤其是外泌體蛋白質組學研究在疾病發生發展、診斷治療以及預后方面都有著巨大的前景,研究外泌體蛋白質組,難點在于外泌體的分離純化和表征,傳統的外泌體分離方式有UC、SEC以及聚合物沉降等方式,每種方式各有優缺點,在此不贅述,但是他們有一個共同的特點是對于血清、血漿或者是體液的用量較大,對于珍貴的臨床樣本;降低前處理的使用量勢在必行,青蓮百奧生物突破下限,創新性的開發磁性納米材料進行外泌體富集,推出Exosome Magic Beads富集試劑盒,將血漿外泌體富集的血漿用量降低到了50μL,尿液外泌體富集僅需要1ml。

圖三外泌體磁珠


50μL正常人血漿和1mL正常人尿液富集的外泌體,進行基于質譜的蛋白質組學檢測,分別檢測到1667和3550個蛋白,如圖四所示;

         圖四MicroEV 表達譜                  圖五 外泌體標志物鑒定結果展示


同時將血漿和尿液外泌體鑒定到的蛋白質分別與2021年6月份發表在Nature cell biology 的“Quantitative proteomics identifies the core proteome of exosomes with syntenin-1 as the highest abundant protein and a putative universal biomarker”一文中提到的外泌體marker數據庫進行了比對文章中提到的24中潛在的外泌體marker此次實驗數據覆蓋到23種,如圖五、圖六、圖七所示;

圖六 尿中外泌體蛋白鑒定累計圖


圖七 血漿中外泌體蛋白鑒定累計圖


以上數據均為青蓮百奧實驗室真實產出,青蓮百奧深耕蛋白質組學多年,積累豐富的樣本前處理經驗及處理方案,尤其在超低特(超微量、低豐度、特異度)方面尤其擅長,致力于樣本量不斷突破下限,做到“毫”無下限;血漿低豐度富集不斷突破檢測深度做到“豪”無上限;外泌體富集純化不斷優化富集策略提高外泌體富集純度做到“好”無破綻。


Alexovi? Michal,Sabo Ján,Longuespée Rémi,Microproteomic sample preparation.[J] .Proteomics, 2021, 21: e2000318.



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