蛋白質組學

北京青蓮百奧生物科技有限公司

多組學推動的精準醫學

服務咨詢熱線

010-53395839

蛋白質組學,糖基化蛋白質組學,多組學聯合分析
您當前的位置 : 首 頁 > 新聞動態 > 公司新聞

「青蓮文章盤點」這里面是堅韌不拔,是厚積薄發,是碩果累累!

2023-01-12 11:45:18

過去的過去

無論多么艱難

留在了2022的年末里

帶著收獲的點點滴滴

踏著堅韌不拔的步伐

向著我們的未來

再出發

祝我們的2023

大展宏“兔”


青蓮百奧憑借高質量質譜平臺,完善的蛋白質組學技術服務解決方案及優質的售前、售中、售后服務,助力客戶實現高分文獻發表及科研項目的突破。小編整理了部分客戶發表的高分文獻,與大家共享科研成果!



青蓮發表文獻


20227月,Frontiers in ImmunologyIF:8.786/Q1期刊上發表了題為“Longitudinal Serum Proteome Characterization of COVID-19 Patients With Different Severities Revealed Potential Therapeutic Strategies”的研究論文,利用TMT蛋白質組學和PRM靶向蛋白質組學,分析了不同嚴重程度的COVID-19患者的血清蛋白質組,提供了由SARS-CoV-2感染引起的血清變化的蛋白質組學景觀,全面解讀了COVID-19患者的分子病理生理特征和異質性,這些研究結果在分子水平上為未來COVID-19患者的治療和檢測提供了新的啟示。(青蓮百奧實驗室團隊完成本文章樣本前處理等實驗部分,青蓮百奧生信總監吳松峰博士,本文一作,負責文章的生信分析部分)。



總結:

此研究使用TMT蛋白質組學策略分析了不同嚴重程度COVID-19患者和對照組的血清樣本,破譯了COVID-19患者的血清分子特征并進行了驗證工作,闡述了COVID-19患者基于血清蛋白質組和與疾病進展相關的血清蛋白質變化的異質性,為疾病的治療提供了思路。




01 | 客戶文獻


標題:TRIB3 reduces CD8+ T cell infiltration and induces immune evasion by repressing the STAT1-CXCL10 axis in colorectal cancer
期刊:Science Translational Medicine(IF:19.319 )
時間:2022.01
點擊圖片查看原文解讀
研究背景:
結直腸癌中CD8+ T細胞浸潤程度高提示預后良好,免疫治療效果滿意,然而,絕大多數CRC患者由于T細胞浸潤不良而不能從免疫治療中獲益,T細胞轉移到腫瘤組織的放松管制是腫瘤T細胞浸潤缺乏的原因之一。TRIB3是一種癌蛋白,多項研究表明TRIB3在免疫應答中具有調節功能,但它在調節抗腫瘤免疫反應中的作用尚未明確。識別這些在結直腸癌中的免疫改變及其潛在機制,可能為改善可能受益于ICB治療的結直腸癌患者的頻率提供新的可能性。
研究過程:
1、探究TRIB3是否參與腫瘤免疫應答的調節
2、證明糖尿病相關的TRIB3表達與CRC組織中CD8+ T細胞的排除有關
3、確定TRIB3通過STAT1-CXCL10信號通路抑制T細胞浸潤
4、探究糖尿病中的高糖狀態是如何誘導TRIB3表達
5、研究互作蛋白乙?;绾巫鳛?/span>TRIB3穩定信號(相互作用蛋白-質譜鑒定-青蓮百奧提供技術支持)
6、確證TRIB3-K240乙?;閷?/span>CRC中高糖誘導的免疫逃逸
此項研究證明了TRIB3在各種CRC小鼠模型中抑制CD8+ T細胞浸潤。發現TRIB3被乙酰轉移酶P300乙?;?,抑制了TRIB3的泛素化和隨后的蛋白酶體降解。異位表達的TRIB3通過增強表皮生長因子受體信號通路,抑制信號轉導和轉錄激活因子1 (STAT1)的激活和STAT1介導的CXCL10轉錄,導致腫瘤浸潤T細胞的減少。這些發現證實了TRIB3CRCsCD8+ T細胞浸潤的負調節因子,突出了治療免疫”CRCs的潛在治療靶點。


02 | 客戶文獻


標題:Spatially resolved proteomic map shows that extracellular matrix regulates epidermal growth.

期刊:Nature Communications  (IF:17.694)

時間:2022.07

點擊圖片查看原文解讀


人體皮膚包括復層鱗狀上皮和真皮,以及各種基質細胞和細胞外基質ECM)?;啄ぃ?/span>BM)是真皮頂部的薄層,通過傳遞物理和生化信號來確定表皮干細胞(EpSCs)極性并維持皮膚組織的層次結構和功能。然而,干細胞生態位如何通過調節EpSCs的行為來維持組織穩態和控制傷口愈合尚未完全清楚。由中國醫學科學院北京協和醫院和蛋白質科學中心(北京)等研究團隊在國際著名學術期刊Nature CommunicationsIF17.694)上聯合發表文獻,在該研究中,使用空間定量蛋白質組學(青蓮百奧提供技術支持)結合脫細胞處理、激光捕獲顯微切割方法構建了分層皮膚蛋白質組圖譜。原位分析了正常皮膚組織和皮膚病組織的不同結構的特定功能。該研究為ECM蛋白如何促進EpSCs的生長和功能提供了見解,有助于未來對于皮膚潰瘍或涉及表皮細胞功能障礙和再上皮化障礙的頑固性皮膚疾病的臨床治療。


03 | 客戶文獻


標題:Establishment of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Skin Organoids Enabled Pathophysiological Model of SARS-CoV-2 Infection

期刊:Advanced Science  (IF:16.806)

時間:2022.03

點擊圖片查看原文解讀
該研究建立了COVID-19患者皮膚的蛋白質組圖譜,并研究了人類誘導的多能干細胞(hiPSC)衍生的具有毛囊和神經系統的皮膚類器官對SARS-CoV-2感染的敏感性。發現新冠病毒能夠感染皮膚毛囊干細胞和神經系統,從而導致毛發脫落和神經元死亡。該研究首次為新冠肺炎和脫發后遺癥之間的關聯提供了證據,也展現了皮膚類器官在病理機制研究和藥物篩選方面的巨大潛力和價值(青蓮百奧承擔了質譜相關數據的產出)。


04 | 客戶文獻


標題:Application of an iPSC-Derived Organoid Model for Localized Scleroderma Therapy

期刊:Advanced Science  IF:17.521)

時間:2022.03

點擊圖片查看原文解讀
該研究建立了LoS皮膚的蛋白質組圖譜,并對LoS皮膚的病理特征進行了表征。然后創建了人源誘導的多能干細胞來源的上皮和間充質(EM)類器官模型對LoS小鼠進行類器官移植治療,發現該策略可以顯著減輕皮膚纖維化的程度,增強皮膚中表皮干細胞的活性,并促進汗腺和血管的再生。這些結果突出了EM類器官模型在促進硬皮病相關表型和皮膚相關功能恢復方面的潛在應用(青蓮承擔了類器官蛋白質組質譜數據的產出)。


05| 客戶文獻


中國醫學科學院&北京協和醫學院藥物研究所宋丹青導師和汪燕翔導師團隊發現并證明了EIF2AK2也可作為BBR抗炎作用的直接關鍵靶點,相關研究成果發表在APSBDiscovery and identification of EIF2AK2 as a direct key target of berberine for anti-inflammatory effects ;IF:14.903;202212月)上。

點擊圖片查看原文解讀

樣本策略:

LPSNigericin誘導PMA-THP-1細胞;EIF2AK2 siRNA誘導HEK-293細胞、HMCC3細胞、Hepg2細胞;EIF2AK2基因敲低小鼠。

技術策略:

LC-MS/MS鑒定(青蓮百奧提供)

總結:

利用化學蛋白質組學技術,我們首次將EIF2AK2、eEF1A1、PRDX3VPS4B鑒定為小檗堿(BBR)協同抗炎作用的直接靶點。其中,BBR通過兩個離子鍵與EIF2AK2具有強的親和力;此外,BBR可以微妙地抑制EIF2AK4的二聚化,以選擇性地調節其下游途徑,包括JNK、NF-κB、AKTNLRP3,具有良好的安全特性的優點。該結果突出了BBR在抗炎作用中的網絡機制,其中EIF2AK2是關鍵靶點,抑制EIF2AK1二聚化有可能成為對抗炎癥相關疾病的治療跨界。



06 | 客戶文獻


標題:The salivary effector protein Sg2204 in the greenbug Schizaphis graminum suppresses wheat defense and is essential for enabling aphid feeding on host plants.
期刊:Plant Biotechnology Journal(IF:13.263)
時間:2022.07
點擊圖片查看原文解讀


小麥是世界主要糧食作物,麥蚜為小麥生產上的重大害蟲,嚴重威脅小麥生產及糧食安全,培育抗蟲小麥品種是防止蚜蟲為害為經濟有效的途徑之一。但蚜蟲為典型的刺吸式害蟲,對寄主植物適應性強,在取食過程中可通過分泌唾液蛋白效應子逃避寄主植物防衛反應。目前針對麥蚜小麥互作分子機制研究不夠深入,導致生產上抗蚜品種長期匱乏。作者通過轉錄組結合蛋白組學鑒定技術(青蓮百奧提供技術支持)發現并首次證明了麥蚜唾液蛋白效應子Sg2204可抑制小麥防御反應從而促進麥蚜的寄主適應性。



07 | 客戶文獻


標題:Proteomic and clinical biomarkers for acute mountain sickness in a longitudinal cohort

期刊:Communications Biology(IF:6.548)

時間20226

點擊圖片查看原文解讀
研究背景:
急性高原?。?/span>AMS常見的高原病之一,也是研究極端環境適應能力的經典模型之一。AMS的診斷依賴于問卷調查形式,并受多種不可控因素的影響。而AMS的發病機制尚不清楚,不能完全通過病理生理過程描述AMS,因此需要探索可靠的AMS生物標志物。
研究策略:

53名前瞻性隊列的漢族個體血漿樣本進行OLINK蛋白質組學檢測和MRM驗證(驗證階段由青蓮百奧生物科技有限公司提供),通過差異分析、機器學習和功能關聯分析,發現并證實RETAMS的發病機制中起著重要作用?;?/span>XGBoost模型的高準確度(AUCs>0.9),將ADAM15、PHGDHTRAF2分別作為保護性、預測性和診斷性生物標志物,為深入探討AMS疾病的致病機制,進一步理解平原人群對高海拔環境的適應性提供了一定的依據。



08 | 客戶文獻


標題:Immune Responses to Multi-Frequencies of 1.5 GHz and 4.3 GHz Microwave Exposure in Rats: T ranscriptomic and Proteomic Analysis

期刊:International Journal of Molecular SciencesIF:6.208

時間:20226

點擊圖片查看原文解讀

技術策略:

在本研究中,研究者設置大鼠假手術組并將Wistar大鼠模型暴露于1.5GHzL10)和4.3GHzC10)單頻或者多頻微波(LC10)中,分別暴露6h、7d、14d28d,利用以下實驗策略為探索多頻微波誘導免疫抑制的潛在機制提供了有意義的信息(蛋白組和轉錄組由北京青蓮百奧生物科技有限公司提供)。
一、檢查了多頻微波對免疫系統造成組織病理學損傷;
二、探查了多頻微波對外周血的免疫影響情況以及外周血中特定細胞因子表達情況;
三、轉錄組分析揭示多頻微波在mRNA水平上的調控表達并進行PCR驗證;
四、蛋白組分析揭示多頻微波調控的相關蛋白并進行PRM驗證;


09 | 客戶文獻


標題:Activity- and Enrichment-Based Metaproteomics Insights into Active Urease from the Rumen Microbiota of Cattle.
期刊:International journal of molecular sciences  (IF:6.208)
時間2022.01

點擊圖片查看原文解讀


調節微生物脲酶活性對于提高尿素利用效率和減少反芻動物對環境的氮排放具有至關重要的作用。處理微生物脲酶的多樣性,確定高活性脲酶為目標是關鍵。

常規使用培養依賴性方法從相關環境樣品中分離和選擇目標酶,但因大量未培養微生物的存在,目前瘤胃中活性脲酶的鑒定受到限制。

作者提出了一種通過基于活性篩選結合宏蛋白質組學(青蓮百奧提供技術支持)鑒定從復雜瘤胃中發現具有高脲酶活性的微生物脲酶方法。



10 | 客戶文獻


標題:Nrf2 Activation Is Involved in Cyclic Mechanical Stress-Stimulated Osteogenic Differentiation in Periodontal Ligament Stem Cells via PI3K/Akt Signaling and HO1-SOD2 Interaction

期刊:Frontiers in Cell and Developmental Biology (IF:6.081)

時間:2022.01

點擊圖片查看原文解讀


核因子E2相關因子2Nrf2)是抗氧化反應和細胞防御的主要轉錄調節因子,對調節成骨分化有重要作用。之前的研究表明,Nrf2的激活參與了循環機械應力刺激的人牙周膜干細胞(PDLSCs)成骨分化。然而,Nrf2在這一過程中的作用機制尚不清楚。該研究通過基于串聯質譜標簽(TMT)的液相色譜串聯質譜(LC-MS/MS)分析(青蓮百奧提供技術支持),探索Nrf2在循環機械應力刺激成骨分化過程中在PDLSCs中的作用機制。


11| 客戶文獻


標題:Transcriptomic and metabolomic landscape of quinoa during seed germination.

期刊:BMC Plant Biology  (IF:5.26)

時間:2022.05

點擊圖片查看原文解讀


作者從藜麥干種子到幼苗的過渡過程中分五個階段進行了轉錄組學研究。結合代謝組分析,發現種子代謝在胚根伸長過程中隨著多種植物激素(尤其是脫落酸)和其他營養物質的顯著改變而改變。細胞壁重構是藜麥種子萌發早期的另一個主要活動過程。光合作用在之后階段完全激活,促進氨基酸和蛋白質的生物合成,使幼苗生長。多組學分析揭示了藜麥種子萌發過程中代謝途徑和表型的全面變化。


12 | 客戶文獻


標題:The D2R-DISC1 protein complex and associated proteins are altered in schizophrenia and normalized with antipsychotic treatment.

期刊:J Psychiatry Neurosci(IF:6.186)

時間:2022.04

點擊圖片查看原文解讀
DISC1是一個與精神分裂癥病因有關的基因,作者發現精神分裂癥患者死后腦組織中D2R-DISC1復合物水平升高。免疫共沉淀實驗確定了大腦中D2R-DISC1復合物水平的升高現象也在血液中存在,對精神分裂癥患者進行抗精神疾病治療后,其血液中的D2RDISC1蛋白復合物水平正?;ń档停?。而后進一步對治療前治療后和對照組進行蛋白組學檢測分析,發現與D2R、DISC1D2RDISC1復合物相關蛋白和通路。確定了與精神分裂癥抗精神病藥物治療相關的其他蛋白質和途徑。


13 | 客戶文獻


標題PSL-LCCL: a resource for subcellular protein localization in liver cancer cell line SK_HEP1

期刊Database(IF:4.462)

時間:2022.02

點擊圖片查看原文解讀


蛋白亞細胞定位的表征為進一步了解細胞行為提供了基礎。人肝癌細胞系(hLCCLs)中蛋白質在膜結合細胞器上的亞細胞定位還有待進一步研究,因此作者通過質譜法對分離并富集了六個膜結合細胞器的蛋白質進行了定量分析,利用marker蛋白和基于機器學習的算法實現了在聚類和鄰域水平上定位蛋白質(青蓮百奧提供技術支持。


14 | 客戶文獻



標題:Identification of key pathways and genes in the progression of silicosis based on WGCNA

期刊:Inhal Toxicol(IF:3.011)
時間:2022.08

點擊圖片查看原文解讀


矽肺是全球常見的職業病之一,尤其是在包括南非和中國在內的發展中。其主要原因是長期吸入大量含有游離二氧化硅顆粒,導致以肺部結節性纖維化為主的疾病,由于治療方式有限且缺乏對疾病機制的了解,矽肺及其導致的纖維化的預后極差。在本研究中,通過氣管內注入不同濃度的二氧化硅建立了Wistar大鼠矽肺纖維化模型,提取肺組織嚴重纖維化病變的RNA進行測序,檢測差異表達基因(DEGs),并通過加權基因共表達網絡分析(WGCNA)鑒定矽肺纖維化相關模塊和hub基因(北京青蓮百奧提供技術支持)。



標簽

0

最近瀏覽:

北京青蓮百奧生物科技有限公司

固話:010-53395839
郵箱:service@qinglianbio.com
地址:北京市海淀區永豐產業基地綠海大廈C座301


掃一掃,關注我們
扒开腿狂躁女人视频